Сам сталкивался с похожей ситуацией: подтупливала коробка, периодически пихалась на небольших скоростях до 40, и, по-ощущениям, упала мощность. Масло в коробке свежее, ошибок по БК нет, двигатель работает как часы, официалы разводят руками, неофициалы разводят руками, коробочники, к которым специально поехал и минут 40 катался с подключенным ноутбуком, развели руками, т.к. проблем никаких нет.
В итоге, в сервисе у знакомых промыли дроссельную заслонку и почистили ДМРВ (датчик массового расхода воздуха) на впуске. И все стало идеально!
Судя по всему, ДМРВ, забиваясь, начинает неверные данные посылать БК, что приводит к несогласованности между работой коробки и двигателя вот с такими проявлениями.